| Dorsal | Jugador | Fecha de nacimiento | Lugar de nacimiento | Fin de contrato | Situación |
| 1 | Jose María CEBALLOS | 07-09-68 | Pámanes (Cantabria) | 2.000 | Contrato en vigor. |
| 3 | Borja Enrique Ayensa "NERU" | 20-01-74 | Santander | Alta. Procede del Racing B. | |
| 4 | Claudio David ARZENO | 16-10-70 | Córdoba (Argentina) | Alta. Procede del Independiente de Avellaneda. | |
| 5 | Olof MELLEBERG | 03-09-77 | Suecia | 2.003 | Alta. Procede del AIK Solna (Suecia). |
| 6 | ISMAEL Ruiz | 02-07-77 | Santander | Contrato en vigor.. | |
| 7 | Jose Manuel Suárez "SIETES" | 18-02-74 | Sietes (Asturias) | 2.000 (opción hasta el 2001) | Contrato en vigor. |
| 8 | David BILLABONA | 05-12-69 | Irún (Guipuzcoa) | 2.001 | Contrato en vigor. |
| 9 | Jesus María MERINO | 07-12-67 | Tudela (Navarra) | Contrato en vigor. | |
| 10 | Angel de Juana "GELI" | 15-02-68 | Santander | 2.001 | Alta. Procede del Celta. |
| 11 | Wladimir BESTCHASTNYKH | 01-04-74 | Moscú (Rusia) | Contrato en vigor. | |
| 12 | F. Javier SANCHEZ JARA | 16-09-69 | Almacelles (Lleida) | Contrato en vigor. | |
| 13 | Fernando MARCOS | 04-12-68 | Felanitx (Mallorca) | 2.000 | Contrato en vigor. |
| 14 | Ángel Manuel VIVAR DORADO | 12-02-74 | Madrid | 2.002 | Alta. Procede del Tenerife |
| 15 | CHEMA Alonso | 29-04-71 | Bilbao (Vizcaya) | 2.002 | Contrato en vigor. |
| 17 | SALVAdor Ballesta | 22-05-75 | Zaragoza | 2.003 | Alta. Procede del Sevilla |
| 18 | VICTOR Sánchez del Amo | 23-02-76 | Madrid | 2.003 | Alta. Procede del R. Madrid. |
| 19 | Sergei SHUSTIKOV | 30-09-70 | Moscú (Rusia) | Contrato en vigor. | |
| 20 | Federico MAGALLANES | 22-08-76 | Montevideo (Uruguay) | 1.999 | Cedido por el R. Madrid. |
| 21 | Emilio AMAVISCA | Laredo (Cantabria) | 2.002 | Alta. Procede del Real Madrid. | |
| 22 | Leider PRECIADO | 26-02-77 | Tumaco (Colombia) | 1.999 (opción de compra) | Alta. Procede del Independiente de Santa Fé (Colombia) |
| 23 | Pedro MUNITIS | 19-06-75 | Santander | 2.002 | Contrato en vigor. |
| 24 | Washington TAIS | 21-12-72 | Montevideo (Uruguay) | 2.001 | Contrato en vigor. |
| 25 | BORJA Lavín | Racing B. | |||
| 26 | MORAtón | Racing B. | |||
| DAVID | Racing B. | ||||
| CESAR PORRAS | Racing B. | ||||
| IVAN | Racing B. | ||||
| Entrenador | Gustavo BENITEZ | Contrato en vigor. | |||
| Segundo Entrenador | Gualberto JARA | Contrato en vigor. | |||
| DANIel COBO | Santander | Cedido al Toledo. | |||
| 21 | Gonzalo COLSA | Santander | Cedido al Logroñés. | ||
| Gonzalo SUANCES | 03-08-72 | Guecho (Vizcaya) | 2.000 | Cedido al Orense. | |
| Fernando MORAN | 27-04-76 | Madrid | 2.000 | Cedido al Orense. | |
| Miguel Angel MORAlejo | 1.999 | Cedido al Jaén. | |||
| NANDO CO | 08-10-73 | Guinea Bissau | Cedido al Vitoria de Setúbal. | ||
| Ilshat FAIZULIN | 05-03-73 | Kemerovo (Rusia) | 2.001 | Cedido al Alberca (Portugal). | |
| ESTEBAN TORRE | 03-09-71 | Santander | 2.000 | Ficha por el Toledo. | |
| Luis DIEGO LOPEZ | 22-08-74 | Montevideo (Uruguay) | Ficha por el Cagliari. | ||
| Ignacio CONTE | 21-02-69 | Zaragoza | Ficha por el Hércules. | ||
| Nelson ABEIJON | 21-07-73 | Montevideo (Uruguay) | 2.001 | Ficha por el Cagliari. | |
| Gabriel F. SCHURRER | 16-08-71 | Santa Fe (Argentina) | 2.000 | Ficha por el Deportivo. | |
| ALBERTO López | 25-02-67 | Madrid | 1.998 | Ficha por el Valladolid. | |
| Fernando CORREA | 06-01-74 | Montevideo (Uruguay) | 2.001 | El Atlético ejerce su opción de recompra. | |
| Oscar ARPON | 09-04-75 | Calahorra (La Rioja) | 1.998 | Regresa al Betis, que lo cede al Mallorca. | |
| Hugo Cardoso PORFIRIO | 28-09-73 | Lisboa (Portugal) | 1.999 (opción hasta el 2.001) | Ficha por el Benfica. | |
| José Félix GUERRERO | 23-08-75 | Portugalete (Vizcaya) | Ficha por la Real Sociedad. | ||
| F. JAVIer LOPEZ | 28-04-73 | Barcelona | Ficha por el Deportivo. | ||
| Rafael MARQUEZ | 16-08-72 | La Coruña | 1.998 | Ficha por el Numancia. |